МКАД был построен за долго до Лужкова еще в СССР, если кто забыл. Развязки "бабочки" на МКАДе, то же не при Лужкове появились. В принципе я об этом писал выше (про "бабочки")
Исходя из этого могу предположить, что всё таки это ошибка в проектировке.
Что Вы прицепились к проектировке? Кроме неё, есть еще масса причин, по которым "бабочки" не реконструировали. Финансовая например, посчитали экономически не целесообразным или просто на тот момент было не по "карману" и меньше всего в этом виноваты проектные институты.
На ТТК, развязки строились из расчета сложившейся застройки, то есть уже стоящих зданий, строений сооружений, поэтому не все развязки ТТК удалось реализовать как бы хотелось.