может быть проблема с датчиками, стоит обратить внимание, на работу коробки влияет например датчик положения дроссельной заслонки и датчик ХХ, у меня была проблема с переключением 3-4 хотя коробка перебрана (не переключало на 4 хотя скорость давно была за 100), заменили датчик заслонки все исправилось. Еще датчик скорости может влиять, в общем надо разбираться.